Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APTXQ7Z2E3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms