Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTY1

SLC16A9, Monocarboxylate transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A9Q7RTY1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC16A9Q7RTY1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC16A9Q7RTY1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC16A9Q7RTY1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC16A9Q7RTY1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC16A9Q7RTY1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC16A9Q7RTY1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms