Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms