Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms