Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms