Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX04

CWC27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC27Q6UX04 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC27Q6UX04 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC27Q6UX04 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC27Q6UX04 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC27Q6UX04 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC27Q6UX04 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC27Q6UX04 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC27Q6UX04 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC27Q6UX04 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC27Q6UX04 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC27Q6UX04 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC27Q6UX04 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC27Q6UX04 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC27Q6UX04 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC27Q6UX04 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC27Q6UX04 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CWC27Q6UX04 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CWC27Q6UX04 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CWC27Q6UX04 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CWC27Q6UX04 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CWC27Q6UX04 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms