Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSSK4Q6SA08 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms