Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms