Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGMBQ6NW40 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms