Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC70Q6NSX1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms