Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms