Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms