Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms