Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms