Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP350Q5VT06 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms