Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms