Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms