Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC39AQ5SRH9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC39AQ5SRH9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC39AQ5SRH9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC39AQ5SRH9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC39AQ5SRH9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC39AQ5SRH9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC39AQ5SRH9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC39AQ5SRH9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC39AQ5SRH9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms