Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms