Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD3Q5JSP0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD3Q5JSP0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD3Q5JSP0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD3Q5JSP0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD3Q5JSP0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD3Q5JSP0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD3Q5JSP0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD3Q5JSP0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD3Q5JSP0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms