Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAN3Q58A45 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms