Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms