Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB5Q2M3G0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB5Q2M3G0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB5Q2M3G0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB5Q2M3G0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB5Q2M3G0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB5Q2M3G0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB5Q2M3G0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB5Q2M3G0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB5Q2M3G0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB5Q2M3G0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB5Q2M3G0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB5Q2M3G0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB5Q2M3G0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB5Q2M3G0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB5Q2M3G0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB5Q2M3G0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB5Q2M3G0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB5Q2M3G0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB5Q2M3G0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB5Q2M3G0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB5Q2M3G0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCB5Q2M3G0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCB5Q2M3G0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCB5Q2M3G0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCB5Q2M3G0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB5Q2M3G0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms