Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms