Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms