Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms