Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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