Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NTRK3Q16288 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
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