Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NPTX1Q15818 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms