Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms