Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
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