Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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