Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms