Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNX3Q13761 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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