Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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