Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAMK2DQ13557 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAMK2DQ13557 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAMK2DQ13557 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAMK2DQ13557 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAMK2DQ13557 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAMK2DQ13557 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAMK2DQ13557 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAMK2DQ13557 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAMK2DQ13557 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms