Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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PTPRSQ13332 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRSQ13332 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRSQ13332 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRSQ13332 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRSQ13332 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRSQ13332 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRSQ13332 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRSQ13332 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRSQ13332 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRSQ13332 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRSQ13332 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRSQ13332 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRSQ13332 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRSQ13332 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRSQ13332 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRSQ13332 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRSQ13332 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms