Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
ATMQ13315 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATMQ13315 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATMQ13315 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATMQ13315 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATMQ13315 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATMQ13315 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATMQ13315 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATMQ13315 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATMQ13315 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATMQ13315 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATMQ13315 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATMQ13315 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATMQ13315 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATMQ13315 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATMQ13315 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATMQ13315 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATMQ13315 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATMQ13315 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATMQ13315 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATMQ13315 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATMQ13315 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATMQ13315 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATMQ13315 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATMQ13315 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATMQ13315 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATMQ13315 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATMQ13315 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATMQ13315 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATMQ13315 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATMQ13315 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATMQ13315 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATMQ13315 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATMQ13315 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATMQ13315 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATMQ13315 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATMQ13315 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATMQ13315 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATMQ13315 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATMQ13315 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATMQ13315 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATMQ13315 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATMQ13315 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATMQ13315 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATMQ13315 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATMQ13315 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATMQ13315 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATMQ13315 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATMQ13315 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATMQ13315 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATMQ13315 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATMQ13315 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATMQ13315 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATMQ13315 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATMQ13315 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATMQ13315 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATMQ13315 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATMQ13315 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATMQ13315 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATMQ13315 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATMQ13315 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATMQ13315 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATMQ13315 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATMQ13315 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATMQ13315 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATMQ13315 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATMQ13315 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATMQ13315 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATMQ13315 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATMQ13315 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATMQ13315 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATMQ13315 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATMQ13315 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATMQ13315 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATMQ13315 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATMQ13315 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATMQ13315 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATMQ13315 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATMQ13315 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATMQ13315 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATMQ13315 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATMQ13315 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATMQ13315 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATMQ13315 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATMQ13315 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATMQ13315 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATMQ13315 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATMQ13315 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATMQ13315 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATMQ13315 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATMQ13315 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATMQ13315 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ATMQ13315 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATMQ13315 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATMQ13315 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ATMQ13315 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATMQ13315 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATMQ13315 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATMQ13315 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATMQ13315 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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