Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN3Q13286 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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