Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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