Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CALCOCO2Q13137 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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