Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
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