Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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