Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCB1Q12824 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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