Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFCP2Q12800 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFCP2Q12800 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFCP2Q12800 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFCP2Q12800 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TFCP2Q12800 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TFCP2Q12800 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFCP2Q12800 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFCP2Q12800 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFCP2Q12800 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFCP2Q12800 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFCP2Q12800 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFCP2Q12800 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFCP2Q12800 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFCP2Q12800 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFCP2Q12800 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFCP2Q12800 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFCP2Q12800 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TFCP2Q12800 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFCP2Q12800 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFCP2Q12800 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFCP2Q12800 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFCP2Q12800 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFCP2Q12800 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFCP2Q12800 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFCP2Q12800 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFCP2Q12800 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFCP2Q12800 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFCP2Q12800 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFCP2Q12800 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFCP2Q12800 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFCP2Q12800 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFCP2Q12800 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFCP2Q12800 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFCP2Q12800 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFCP2Q12800 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFCP2Q12800 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFCP2Q12800 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TFCP2Q12800 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 334.9 ms