Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.14□□□□□ -2.07
TY1A-NL1Q12391 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.14□□□□□ -2.07
TY1A-NL1Q12391 COA6YMR244C-A 315 nt2.14□□□□□ -2.07
TY1A-NL1Q12391 NUP157YER105C 4176 nt2.14□□□□□ -2.07
TY1A-NL1Q12391 TUS1YLR425W 3924 nt2.14□□□□□ -2.07
TY1A-NL1Q12391 MSB1YOR188W 3414 nt2.14□□□□□ -2.07
TY1A-NL1Q12391 TOP2YNL088W 4287 nt2.13□□□□□ -2.07
TY1A-NL1Q12391 DNF1YER166W 4716 nt2.13□□□□□ -2.07
TY1A-NL1Q12391 PDR11YIL013C 4236 nt2.13□□□□□ -2.07
TY1A-NL1Q12391 SCD5YOR329C 2619 nt2.13□□□□□ -2.07
TY1A-NL1Q12391 GCN2YDR283C 4980 nt2.13□□□□□ -2.07
TY1A-NL1Q12391 HSL1YKL101W 4557 nt2.12□□□□□ -2.07
TY1A-NL1Q12391 SEC1YDR164C 2175 nt2.12□□□□□ -2.07
TY1A-NL1Q12391 YML002WYML002W 2214 nt2.11□□□□□ -2.07
TY1A-NL1Q12391 YOL098CYOL098C 3114 nt2.11□□□□□ -2.07
TY1A-NL1Q12391 SEY1YOR165W 2331 nt2.11□□□□□ -2.07
TY1A-NL1Q12391 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt2.11□□□□□ -2.07
TY1A-NL1Q12391 YJR039WYJR039W 3366 nt2.11□□□□□ -2.07
TY1A-NL1Q12391 RTP1YMR185W 2946 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1A-NL1Q12391 SPO24YPR036W-A 204 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1A-NL1Q12391 SEC21YNL287W 2808 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1A-NL1Q12391 HIR3YJR140C 4947 nt2.09□□□□□ -2.07
TY1A-NL1Q12391 SFB2YNL049C 2631 nt2.09□□□□□ -2.08
TY1A-NL1Q12391 TRM3YDL112W 4311 nt2.08□□□□□ -2.08
TY1A-NL1Q12391 KOG1YHR186C 4674 nt2.08□□□□□ -2.08
TY1A-NL1Q12391 RTT107YHR154W 3213 nt2.08□□□□□ -2.08
TY1A-NL1Q12391 TOF1YNL273W 3717 nt2.08□□□□□ -2.08
TY1A-NL1Q12391 SMC1YFL008W 3678 nt2.07□□□□□ -2.08
TY1A-NL1Q12391 MBB1YJL199C 327 nt2.07□□□□□ -2.08
TY1A-NL1Q12391 YLR232WYLR232W 348 nt2.07□□□□□ -2.08
TY1A-NL1Q12391 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt2.07□□□□□ -2.08
TY1A-NL1Q12391 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt2.06□□□□□ -2.08
TY1A-NL1Q12391 TFC3YAL001C 3483 nt2.06□□□□□ -2.08
TY1A-NL1Q12391 SET3YKR029C 2256 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1A-NL1Q12391 SSD1YDR293C 3753 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1A-NL1Q12391 CSF1YLR087C 8877 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1A-NL1Q12391 UFD4YKL010C 4452 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1A-NL1Q12391 RTT101YJL047C 2529 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1A-NL1Q12391 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.04□□□□□ -2.08
TY1A-NL1Q12391 FYV10YIL097W 1551 nt2.04□□□□□ -2.08
TY1A-NL1Q12391 KRE33YNL132W 3171 nt2.04□□□□□ -2.08
TY1A-NL1Q12391 UTP21YLR409C 2820 nt2.03□□□□□ -2.09
TY1A-NL1Q12391 MSH6YDR097C 3729 nt2.03□□□□□ -2.09
TY1A-NL1Q12391 PDR3YBL005W 2931 nt2.02□□□□□ -2.09
TY1A-NL1Q12391 GYP5YPL249C 2685 nt2.02□□□□□ -2.09
TY1A-NL1Q12391 PAN2YGL094C 3348 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1A-NL1Q12391 TIM9YEL020W-A 264 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1A-NL1Q12391 YLR041WYLR041W 321 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1A-NL1Q12391 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1A-NL1Q12391 NUT1YGL151W 3399 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1A-NL1Q12391 DNA2YHR164C 4569 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1A-NL1Q12391 MMS4YBR098W 2076 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1A-NL1Q12391 RAD50YNL250W 3939 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1A-NL1Q12391 ALY2YJL084C 3141 nt2□□□□□ -2.09
TY1A-NL1Q12391 NAB6YML117W 3405 nt2□□□□□ -2.09
TY1A-NL1Q12391 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt2□□□□□ -2.09
TY1A-NL1Q12391 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2□□□□□ -2.09
TY1A-NL1Q12391 IRA2YOL081W 9240 nt2□□□□□ -2.09
TY1A-NL1Q12391 BPH1YCR032W 6504 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1A-NL1Q12391 YAR009CYAR009C 3591 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1A-NL1Q12391 RPS26AYGL189C 360 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1A-NL1Q12391 DGR1YNL130C-A 147 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1A-NL1Q12391 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1A-NL1Q12391 BNI1YNL271C 5862 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1A-NL1Q12391 SPP41YDR464W 4308 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1A-NL1Q12391 SLN1YIL147C 3663 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1A-NL1Q12391 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt1.97□□□□□ -2.09
TY1A-NL1Q12391 SEC16YPL085W 6588 nt1.97□□□□□ -2.09
TY1A-NL1Q12391 MYO2YOR326W 4725 nt1.97□□□□□ -2.09
TY1A-NL1Q12391 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt1.96□□□□□ -2.1
TY1A-NL1Q12391 BRE1YDL074C 2103 nt1.95□□□□□ -2.1
TY1A-NL1Q12391 snR53snR53 91 nt1.95□□□□□ -2.1
TY1A-NL1Q12391 HER1YOR227W 3741 nt1.95□□□□□ -2.1
TY1A-NL1Q12391 STH1YIL126W 4080 nt1.95□□□□□ -2.1
TY1A-NL1Q12391 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt1.94□□□□□ -2.1
TY1A-NL1Q12391 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt1.94□□□□□ -2.1
TY1A-NL1Q12391 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt1.94□□□□□ -2.1
TY1A-NL1Q12391 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt1.94□□□□□ -2.1
TY1A-NL1Q12391 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt1.94□□□□□ -2.1
TY1A-NL1Q12391 YPR097WYPR097W 3222 nt1.94□□□□□ -2.1
TY1A-NL1Q12391 RGA1YOR127W 3024 nt1.93□□□□□ -2.1
TY1A-NL1Q12391 KIP1YBL063W 3336 nt1.93□□□□□ -2.1
TY1A-NL1Q12391 snR70snR70 164 nt1.93□□□□□ -2.1
TY1A-NL1Q12391 EMC5YIL027C 426 nt1.93□□□□□ -2.1
TY1A-NL1Q12391 snR190snR190 190 nt1.93□□□□□ -2.1
TY1A-NL1Q12391 UBP2YOR124C 3819 nt1.92□□□□□ -2.1
TY1A-NL1Q12391 MYO4YAL029C 4416 nt1.92□□□□□ -2.1
TY1A-NL1Q12391 NOP9YJL010C 2001 nt1.92□□□□□ -2.1
TY1A-NL1Q12391 UTP22YGR090W 3714 nt1.92□□□□□ -2.1
TY1A-NL1Q12391 snR47snR47 99 nt1.91□□□□□ -2.1
TY1A-NL1Q12391 TDA9YML081W 3756 nt1.9□□□□□ -2.1
TY1A-NL1Q12391 UBR2YLR024C 5619 nt1.9□□□□□ -2.1
TY1A-NL1Q12391 snR14snR14 160 nt1.9□□□□□ -2.11
TY1A-NL1Q12391 RPL26BYGR034W 384 nt1.89□□□□□ -2.11
TY1A-NL1Q12391 YLR419WYLR419W 4308 nt1.88□□□□□ -2.11
TY1A-NL1Q12391 CHS1YNL192W 3396 nt1.87□□□□□ -2.11
TY1A-NL1Q12391 SMC4YLR086W 4257 nt1.87□□□□□ -2.11
TY1A-NL1Q12391 GLG1YKR058W 1851 nt1.86□□□□□ -2.11
TY1A-NL1Q12391 TOR2YKL203C 7425 nt1.86□□□□□ -2.11
TY1A-NL1Q12391 SEC10YLR166C 2616 nt1.86□□□□□ -2.11
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