Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms