Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms