Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNA1Q09470 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms