Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms